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蛋白质数据+基因序列精准构建进化树
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作者:
p30900
時間:
昨天 10:20
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蛋白质数据+基因序列精准构建进化树
进化树对于理解生物间的亲缘关系、病原体传播路径、疫苗研发及新发疾病治疗非常重要。传统上,科学家通过比较DNA或蛋白质的线性序列来构建进化树,但这种方法在处理非常古老的物种时,遇到了“饱和问题”。这是因为随着时间推移,基因组序列变化很大,以至于原始的遗传信息几乎消失。这就如同古老文本因时间久远而字迹模糊,难以辨认。
为了解决这个问题,团队开始关注蛋白质的物理结构。因为这些结构比序列更稳定,能够更长时间保留祖先的特征。即使氨基酸序列发生变化,只要保持了相同的三维折叠模式,蛋白质就能继续发挥相同的功能。
此次团队使用了一种名为“互距离分布”(IMD)的方法,测量了蛋白质内部氨基酸之间的距离,以此来评估结构的变化程度。他们发现,基于这种结构信息构建的进化树,可以避免传统方法遇到的饱和问题,并且能提供更加可靠的进化关系图谱。
当把蛋白质结构和序列信息结合起来时,就像让两位目击者从不同角度描述同一事件,这样可以获得更为完整、准确的结果。例如,在人类基因组中的激酶家族,它们参与了许多细胞活动,也是癌症治疗的重要靶点,通过这种方法可以更好地理解这些激酶之间的进化关系。
该技术的应用潜力十分巨大,不仅有助于人们改进癌症治疗方法,还可以加深对疾病演变的理解,从而促进医疗进步。
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